Базы данных

Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН обладает уникальными базами данных.

База данных «Протеомика рака простаты»
По итогам протеомных исследований образцов тканей простаты со злокачественными и доброкачественными опухолями, сформирована многоуровневая компьютерная база данных «Протеомика рака простаты» (http://ef.inbi.ras.ru/), которая зарегистрирована в Государственном реестре баз данных (регистрационный номер 2012620676 от 13.07.2012).
База данных «Протеомика рака простаты» содержащая 302 белковые фракции. Среди идентифицированных в Институте биохимии им. А.Н.Баха белков оказалось 10 новых, для некоторых из которых зарегистрированы резкие количественные изменения, связанные с клеточной дифференцировкой, что представляется перспективным для диагностических целей.

База данных «Протеомика мышечных органов»
Сформирована многомодульная база данных «Протеомика мышечных органов» (http://mp.inbi.ras.ru/), которая содержит комплексные модули «Белки миокарда» и «Белки миобластов» (всего более 300 идентифицированных мышечных белков).

База данных по олигопептидам EROP-Moscow
База данных EROP-Moscow (Endogenous Regulatory OligoPeptides) с онлайн-доступом (http://erop.inbi.ras.ru/) о структуре и функциях природных олигопептидов.
Природные олигопептиды, содержащие от 2 до 50 аминокислотных остатков  являются регуляторами практически всех жизненно важных процессов. К настоящему времени известна химическая структура почти 6000 олигопептидов, выделенных из живых организмов более чем 1000 биологических видов — представителей всех биологических империй/царств. Среди них нейропептиды представляют самый большой функциональный класс, насчитывающий более 1300 природных структур.
Для формирования клиент-серверной базы данных была проведена формализация химических, биологических и других характеристик природных олигопептидов, образующихся в результате рибосомального матричного, нерибосомального матричного или ферментативного синтеза. К настоящему времени число структурах природных олигопептидов в базе данных составляет более 9000.

Электронная система аннотации бактериальных генов
Web-сайт для аннотации бактериальных генов (http://genefunction.ru). Создан сотрудниками группы математического анализа последовательностей ДНК и белков (Руководитель: д.б.н. Коротков Е.В.).