ЦКП «Коллекция уникальных и экстремофильных микроорганизмов различных физиологических групп биотехнологического назначения UNIQEM» (далее «Коллекция UNIQEM») основан на базе Федерального государственного учреждения «Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» Российской академии наук».

Положение о ЦКП «Коллекция UNIQEM» утверждено в 2017 году. Коллекционный фонд микроорганизмов создан в Институте микробиологии им. С.Н. Виноградского.

Основное направление ЦКП состоит в выделении непатогенных микроорганизмов из природных и антропогенных экосистем, установлении их таксономической принадлежности и физиолого-биохимических свойств, оценке биотехнологического потенциала, сохранении и поддержании штаммов в жизнеспособном состоянии, предоставлении штаммов и информации о них для научных, образовательных и производственных организаций.

Существенная часть коллекционного фонда ЦКП была выделена, исследована и описана (в том числе, как представители новых родов, семейств и филумов) в ходе многолетних инициативных исследований сотрудников Института микробиологии им. С.Н. Виноградского ФИЦ Биотехнологии РАН. В коллекции UNIQEM имеются микроорганизмы нового или неопределенного таксономического статуса, трудно поддающиеся культивированию и не дублирующиеся в других коллекциях.

ЦКП «Коллекция UNIQEM» и сотрудничающие с ним структурные подразделения ФИЦ Биотехнологии РАН располагают полным комплексом современных методов и оборудования для обеспечения научно-сервисных услуг по изучению микробного разнообразия. Для сохранения коллекционного фонда используются различные методы культивирования и поддержания микроорганизмов (в зависимости от их особенностей) и режимы длительного хранения, в том числе, в криоконсервированном виде.

ЦКП «Коллекция UNIQEM» располагает помещениями, оборудованием (боксами для пересевов, термостатами, анаэростатами, холодильными камерами, криохранилищами и др.), расходными материалами (питательными средами, реактивами, стеклянной и пластиковой посудой и др.), набором методик для поддержания штаммов микроорганизмов для сохранения и резервирования текущих ресурсов. Молекулярно-генетические исследования штаммов микроорганизмов осуществляются на базе ЦКП «Биоинженерия» ФИЦ Биотехнологии РАН.

Основные направления научных исследований:

• Изучение разнообразия, метаболизма и биогеохимической деятельности микроорганизмов различных мест обитания с анализом рибосомальных генов и генов, кодирующих ключевые ферменты, или полного генома.
• Выявление и описание новых таксонов прокариот.
• Поддержание и пополнение коллекций прокариот (в том числе, экстремофилов), обладающих биотехнологическим потенциалом для получения высокостабильных ферментов и широкого спектра биологически активных веществ, использования в биогидрометаллургии,  повышения нефтеотдачи, переработки отходов, очистки сточных вод и решения других задач.
• Изучение форм длительного выживания и  механизмов адаптации бактерий к экстремальным условиям.
• Оптимизация способов хранения микробных культур (в том числе, за счет перевода в покоящееся состояние) и разработка приемов реактивации клеток, утративших способность к прорастанию.
• Изучение ультраструктурных характеристик клеток новых изолятов и длительно выживающих форм.

Каталог коллекции микроорганизмов UNIQEM

Краткая информация:

Контакты:
Руководитель ЦКП «Коллекция UNIQEM»
Мулюкин Андрей Львович, д.б.н., в.н.с.

+7 (499) 135-12-29  доб. 751
uniqem@fbras.ru, andlm@mail.ru

ОФИЦИАЛЬНЫЕ ДОКУМЕНТЫ ЦКП «КОЛЛЕКЦИЯ UNIQEM»

ПРИКАЗ О СОЗДАНИИ ЦКП «КОЛЛЕКЦИЯ UNIQEM»
ПОЛОЖЕНИЕ О ЦКП «КОЛЛЕКЦИЯ UNIQEM»
ПОЛОЖЕНИЕ О КОЛЛЕКЦИИ UNIQEM
РЕГЛАМЕНТ ДОСТУПА К ОБОРУДОВАНИЮ И РЕСУРСАМ

ОБОРУДОВАНИЕ ЦКП «КОЛЛЕКЦИЯ UNIQEM»

Основное оборудование, закрепленное за ЦКП

Основное оборудование структурных подразделений и служб ФИЦ Биотехнологии РАН, используемое в работе ЦКП

Сведения о метрологическом обеспечении

УСЛУГИ, ПРЕДОСТАВЛЯЕМЫЕ ЦКП

В ЦКП «Коллекция UNIQEM» налажена система лиофильной сушки бактериальных культур с запаиванием ампул (объем вносимой суспензии клеток или спор 0,3-0,4 мл). За один сеанс возможно получение не более 12 ампул. Не принимаются природные образцы (почвы, нефть, донные осадки и т.д.), а также патогенные микроорганизмы.

По вопросам лиофильной сушки культур микроорганизмов обращаться к Захаровой Елене Евгеньевне vilenta@gmail.com)

 Приказ ФИЦ Биотехнологии РАН № 82-Д от 14.05.2021 «Об индексации цен на услуги Центров коллективного пользования ФИЦ Биотехнологии РАН»

 Обновленные цены на услуги ЦКП «Коллекция уникальных и экстремофильных микроорганизмов различных физиологических групп биотехнологического назначения UNIQEM»
(Приложение 3 к Приказу ФИЦ Биотехнологии РАН № 82-Д от 14.05.2021)

Перечень услуг, предоставляемых ЦКП «Коллекция UNIQEM»:

• • Предоставление штаммов микроорганизмов (единиц хранения) внутренним и внешним пользователям для некоммерческого использования;
  • Хранение непатогенных микроорганизмов, не входящих в перечень I — III групп (в соответствии с действующими Санитарно-эпидемиологическими правилами СП 1.3.2322-08);
  • Консультации высококвалифицированных специалистов по вопросам культивирования, поддержания, хранения штаммов;
  • Проведение микроскопических исследований (в том числе, на базе центра микробной цитологии);
  • Предоставление ресурсов для обучения студентов и выполнения бакалаврских и магистерских работ в рамках сотрудничества с ВУЗами.

Проект гражданско-правового договора на предоставление услуги

Примеры упоминания оборудования и ресурсов ЦКП «Коллекция UNIQEM» в публикациях

Письмо-запрос на оказание услуги, предоставляемой ЦКП «Коллекция UNIQEM»

ЗЛЕКТРОННАЯ ЗАЯВКА НА ОКАЗАНИЕ УСЛУГИ «МИКРОСКОПИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ»

ЭЛЕКТРОННАЯ ЗАЯВКА НА ОКАЗАНИЕ УСЛУГИ «ПРЕДОСТАВЛЕНИЕ ШТАММОВ»

ЭЛЕКТРОННАЯ ЗАЯВКА НА ОКАЗАНИЕ УСЛУГИ «ХРАНЕНИЕ ШТАММОВ»

ЭЛЕКТРОННАЯ ЗАЯВКА НА ОКАЗАНИЕ УСЛУГИ »КОНСУЛЬТАЦИИ»

Стандартные операционные процедуры (СОП)	Итоговая таблица расчета сметы стоимости выполнения СОП	Результаты верификации СОП в ходе выполнения дополнительного государственного задания на 2017 г.
СОП-1 по поддержанию штаммов микроорганизмов в живых культурах
СОП-2 по подготовке культур микроорганизмов к криоконсервации
СОП-3 по контролю качества единиц хранения
СОП-4 по коррекции нарушений качества единиц хранения
СОП-5 по проверке аутентичности коллекционного фонда микроорганизмов
СОП-6 по выделению штаммов микроорганизмов из разнообразных природных источников, в т.ч. экстремальных мест обитания
СОП-7 по идентификации штаммов микроорганизмов методом секвенирования маркерных последовательностей
СОП-8 по электронно-микроскопическому исследованию ультратонких срезов клеток микроорганизмов
СОП-9 по микроскопированию культур и клеточных суспензий (в том числе, с применением флуоресцентных красителей)

Итоговая таблица величины накладных расходов      

КАТАЛОГ КОЛЛЕКЦИИ МИКРООРГАНИЗМОВ UNIQEM

Коллекционный фонд ЦКП «Коллекция UNIQEM» представлен бактериями и археями различных таксономических и физиологических групп (в том числе, экстремофилами: термофилами, ацидофилами, алкалофилами, галофилами и др.).

Первая версия каталога организована в виде алфавитного списка микроорганизмов (с обозначением T для типовых штаммов) с возможностью перехода к подробному описанию штамма. Каталог составлен по результатам комплексной инвентаризации свыше 100 штаммов и проверки сохранности их жизнеспособности, проведенных за IV квартал 2016 г. в рамках Госзадания «Коллекция уникальных и экстремофильных микроорганизмов биотехнологического назначения» (№ ИСГЗ) 0104-2016-0001 и будет пополняться.

Каталог коллекции уникальных и экстремофильных микроорганизмов
различных физиологических групп биотехнологического назначения UNIQEM

*T — типовой штамм