Лауреат стипендии имени В.Л. Кретовича 2017


Научно-технический совет Института биохимии им. А.Н. Баха
своим решением на основании тайного голосования по докладу
«Протеомное изучение DJ-1 и некоторых других белков, участвующих
в регуляции жизнеспособности культивируемых опухолевых клеток человека»

присудил стипендию имени члена-корреспондента РАН В.Л. КРЕТОВИЧА на 2017 год
Пашинцевой Наталье Валентиновне
(решение Совета от 27.01.2017 г.)

 

Н.В. ПАШИНЦЕВА
м.н.с., аспирант 4 года обучения
Лаборатория биомедицинских исследований
Научные руководители: зав. лаб., д.б.н., профессор Шишкин Сергей Сергеевич, к.б.н. Лисицкая Ксения Валерьевна

 

АННОТАЦИЯ РАБОТЫ

DJ-1 является одним из белков, обеспечивающих жизнеспособность опухолевых клеток человека. При помощи двумерного электрофореза фракции белка DJ-1 были выявлены и идентифицированы масс-спектрометрическими методами в нескольких линиях злокачественных эпителиальных и мезенхимальных клеток (OKP-GS, HT-29, 769-Р, U2-OS, SK-UT-1B, RD). В клеточной линии остеосаркомы выявлены две электрофоретические изоформы белка DJ-1. Протеомными методами также были изучены некоторые другие белки, регулирующие жизнеспособность клеток и имеющие различную количественную представленность на двумерных электрофореграммах (ДЭ) нормальных и злокачественных клеток. Так, актин-связывающий белок CFL1 незначительно отличался в количестве, в то время как SFPQ и hnRNP А1 варьировали значительно. Фракции SFPQ и hnRNP А1 были идентифицированы во всех изученных злокачественных клеточных линиях аденокарцином и сарком. Более того, эти белки присутствовали на ДЭ в трех электрофоретических изоформах. В линии рабдомиосаркомы RD в ходе тандемной масс-спектрометрии было обнаружено фосфорилирование SFPQ по треонину в 168 положении, о котором ранее не сообщалось в базе данных Uniprot.

При протеомном анализе культивируемых стволовых клеток человека на ДЭ белок SFPQ не определялся, а DJ-1 и hnRNP A1 присутствовали в гораздо меньших количествах по сравнению с злокачественными клетками (например, hnRNP A1 в стволовых клетках не выявлялся при обычной окраске Кумасси R-250, но его удавалось детектировать при окраске нитратом серебра). На ДЭ нормальных мышечных клеток человека SFPQ не определялся, а DJ-1 и hnRNP A1 были выявлены только на стадии роста и не были обнаружены на стадии индукции дифференцировки. Таким образом, белки DJ-1 и hnRNP А1 являются маркерами активной пролиферации клеток с количественным преобладанием в злокачественных клетках, а белок SFPQ, определяясь только в опухолевых клетках человека,  может считать потенциальным биомаркером злокачественных новообразований как эпителиального, так и мезенхимального происхождения.

Результаты, полученные при изучении протеомных профилей ранее не исследовавшихся в лаборатории культивируемых злокачественных и нормальных клеток человека, были использованы при формировании новой многоуровневой базы данных «Протеомика злокачественных клеток».

ПУБЛИКАЦИИ
Основные публикации:

  1.  Пашинцева Н.В., Лисицкая К.В., Ковалев Л.И., Еремина Л.С., Шишкин С.С. Протеомное изучение белков в культивируемых клетках  рабдомиосаркомы (RD) и некоторых других клетках. Современные проблемы науки и образования, №5, 2015.
  2. Pashintseva N.V., Shishkin S.S., Lisitskaya K.V., Kovalev L.I., Kovaleva M.A., Eryomina L.S., Kamenikhina I.A., Novikova L.A., Sadykhov E.G. Study of Splicing Factor, Proline- and Glutamine-rich by Proteomic Techniques in Human Malignant and Nonmalignant Cell Lines. Protein & Peptide Letters 2016. V.23 (11). P. 958-966.
  3. Шишкин С.С., Ковалев Л.И., Пашинцева Н.В, Еремина Л.С., Иванов А.В., Садыхов Э.Г. Протеомные базы данных в России. Биотехнологические аспекты. Актуальная биотехнология. 2016. №3 (18) С.42-47. ISSN 2304-4691.
  4. Shishkin S.S., Eremina L.S, Pashintseva N.V., Kovalev L.I., Kovaleva M.A. Cofilin-1 and Other ADF/Cofilin Superfamily Members in Human Malignant Cells. Int J Mol Sci. 2016 Dec 22;18(1). pii: E10. doi: 10.3390/ijms18010010.

Тезисы докладов:

  1. Пашинцева Н.В., Ковалев Л.И, Ковалева М.А., Еремина Л.С., Лисицкая К.В., Иванов А.В., Шишкин С.С. Белок DJ-1 в культивируемых клетках рабдомиосаркомы человека (линия RD). Сборник научных трудов по итогам международной научно-практической конференции «Проблемы медицины в современных условиях», — Казань: 2014. – С. 151–153 (тезисы).
  2. Pashintseva N.V., Kovalyov L.I., Kovalyova M.A., Eryomina L.S., Lisitskaya K.V., Ivanov A.V., Shishkin S.S. Proteomic study of DJ-1 protein in cultured human cells and mammalian muscle tissues. Biologic motility: new facts and hypotyses. – Pushino: ITEB RAS – 2014. – 206–208 (постерный доклад).
  3. Пашинцева Н.В., Лисицкая К.В., Ковалев Л.И., Ковалева М.А., Еремина Л.С., Иванов А.В., Шишкин С.С. Протеомное изучение белков в клетках линии RD (рабдомиосаркома человека), идентификация белка SFPQ – потенциального биомаркера опухолевого процесса. Сборник трудов IV международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине». – Казань: 2014 (постерный доклад).
  4. Пашинцева Н.В, Еремина Л.С. Лисицкая К.В., Ковалев Л.И., Шишкин С.С. HnRNPs, SFPQ и другие белки, обеспечивающие сплайсинг, в нормальных и опухолевых культивируемых клетках человека. ACTA NATURAE СПЕЦВЫПУСК том 2 2016, С. 69. (Научные труды 5 съезда биохимиков России, Сочи –  Дагомыс, Россия 4 – 8 октября 2016).

 

Подробная информация о стипендии имени члена-корреспондента РАН Вацлава Леоновича Кретовича: http://www.fbras.ru/meropriyatiya-centra/konkurs-kretovicha