Лаборатория молекулярного имиджинга


Богданов Алексей Алексеевич

Заведующий лабораторией
доктор биологических наук, профессор
ИНБИ, корп. 3, комн. 33
E-Mail bogdanov.alexei@gmail.com

Основное

ОПИСАНИЕ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ ЛАБОРАТОРИИ

Ключевые слова
молекулярная визуализация, флуоресцентный имиджинг с временным разрешением, магнитно-резонансная томография, протеиназы, флуоресцентные цветные белки,  генетически-кодируемые сенсоры,  воспаление, канцерогенез

Краткая история лаборатории
Лаборатория молекулярного имиджинга  сформирована  в 2018 году на базе ФИЦ Биотехнологии РАН в соответствии с Постановлением №220  Правительства РФ от 09.04.2010 для выполнения работ по гранту № 14.W03.31.0023 Минобрнауки России «​​​​​Визуализация и инженерия эукариотических геномов» в  рамках подпрограммы «Институциональное развитие научно-исследовательского сектора» государственной программы Российской Федерации «Развитие науки и технологий» на 2013 – 2020 годы.

КАРТОЧКА ПРОЕКТА «​​​​​Визуализация и инженерия эукариотических геномов»

 

Достижения

ОСНОВНЫЕ ДОСТИЖЕНИЯ

 

Сотрудники

СОСТАВ ЛАБОРАТОРИИ

ФИО Ученая степень, звание Должность Место работы Городской телефон Внутренний телефон E-mail
1Богданов
Алексей Алексеевич
профессор, д.б.н.зав. лабораториейИНБИ, корп. 3, комн. 33
2Жердева
Виктория Вячеславовна
к.б.н.с.н.с.ИНБИ, корп. 1, комн. 223(495) 660-34-30 доб.194(495) 952-87-99 (тел/факс)194vjerdeva@inbi.ras.ru
3Казачкина
Наталия Ивановна
к.б.н.с.н.с.ИНБИ, корп. 1, комн. 223(495) 660-34-30 доб.194(495) 952-87-99 (тел/факс)194nkazachkina@inbi.ras.ru

Оборудование

УНИКАЛЬНОЕ ОБОРУДОВАНИЕ

 

Публикации

ЗНАЧИМЫЕ ПУБЛИКАЦИИ

ОТЕЧЕСТВЕННЫЕ ГРАНТЫ И ХОЗДОГОВОРА (2014-2015гг.)

№ пп Наименование работы № лота, контракта, соглашения, субсидии Финансирующая организация Наименование программы Период проведения работ Соисполнитель Руководитель работ
1. Синтез потенциальных ингибиторов матриксной металлопротеиназы-2 и изучение их свойств in vitro и in vivo 14-04-01266 Российский фонд фундаментальных исследований 2014-2016 Жердева В.В.
2. Изучение закономерностей воздействия фотодинамической терапии на злокачественные клетки и опухоли на молекулярно-биохимическом уровне 14-02-00934 Российский фонд фундаментальных исследований 2014-2016 Меерович И.Г
3. Разработка метода прижизненной визуализации протеиназной активности в опухолях in vivo 14-08-01017 Российский фонд фундаментальных исследований 2014-2016 Казачкина Н.И.
4. Флуоресцентные сенсоры нового поколения для детекции протеолитической активности в живых клетках и организмах 13-04-40305-Н РФФИ-КОМФИ 2013-2015 ИБХ Савицкий А.П.
5. Изучение структуры и спектрально-флуоресцентных свойств цветных флуоресцирующих белков из кораллов и создание на их основе клеточных сенсоров для субдифракционной сверхразрешающей молекулярной визуализации биохимических процессов в клетках Президиум РАН Молекулярная и клеточная биология 2014-2018 Савицкий А.П.
6. Современные методы молекулярного флуоресцентного имиджинга с высоким пространственным и временным разрешением 15-14-30019 Российский научный фонд Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований с представлением результатов в рамках международной конференции (конгресса 2014-2017 Савицкий А.П.

 

  • Anton Yu. Sdobnov, Maxim E. Darvin, Johannes Schleusener, Jürgen Lademann, Valery V. Tuchin. Hydrogen bound water profiles in the skin influenced by optical clearing molecular agents- quantitative analysis using confocal Raman microscopy. J.Biophotonics jbio.201800283R2  (WoS, Q1, IF 3.768,  SJR 1.03)
  • A. Yu. Sdobnov, J. Lademann, M. E. Darvin, and V. V. Tuchin. Sensors for Proteolytic Activity Visualization and Their Application in Animal Models of Human Diseases, Biochemistry-Moscow, Vol.84, Supplement1, S144-S158. WoS, Q4,  I F 1.724,  SJR 0.16)
  • A.A. Bogdanov, I.D. Solovyev, A.P. Savitsky. Sensors for Proteolytic Activity Visualization and Their Application in Animal Models of Human Diseases. Vol.84, Supplement1, S1-S18.
    (WoS, Q4,  I F 1.724,  SJR 0.16)

Обзоры:

Подготовка и редактирования сборника «Успехи биологической химии», Т.59 по тематике проекта. Обзоры в выпуске п.3,4.

Выступления на конференциях и тезисы докладов на конференциях:

  • Keynote Paper: Alexei A. Bogdanov, Valeriy Metelev, Toloo Taghian, Ilya D. Solovyev, Anand T. N. Kumar, Surong Zhang, Alexander Savitsky, “Time-resolved fluorescence for detecting of rapidly activated transcription factor interaction with the near-infrared oligonucleotide probes in vitro and in situ” (Keynote presentation)     SPIE Photonics West Symposia, Conference: Dynamics and Fluctuations in Biomedical Photonics XVI,     February, 3,  2019, Paper 10877-17.
  • Tuchina, DK, Olga A. Sindeeva, Alexander P. Savitsky, Alexei A. Bogdanov, Jr., Valery V. Tuchin “MRI contrast media as optical clearing agents: perspectives for tissue multimodal imaging “ 15th International Conference on Laser Applications in Life Sciences (LALS), Bar-Ilan University, Tel Aviv, Israel. November,18-20 2018. https://www.lals.org.il/wp- content/uploads/sites/10/2018/ 04/posters.pdf
  • Taghian Т,  Metelev VG, Solovyev I, Savitsky A, Bogdanov AA Jr. Near-infrared fluorescent probe for detecting functional activity of NF-kappaB in pancreas tissue of pre-diabetic mouse model of type 1 diabetes. Proc. 2018 World Molecular Imaging Congress,  Seattle WA, September 10-15, 2018   Abstract P021 (Poster)
  • ZherdevaV.V.,  Mardanova R.U., Savitsky A.P. Relevance of the Method for Spheroids Obtaining: Impact on Biochemical and Pharmacological Properties of Tumor Spheroid Models Visualized by FLIM. 3rd School on ADFLIM, Saratov State University, Saratov, September  24-28 http://www.adflim.org/ abstracts_proceedings.html
  • Gavshina A.V., Solovyev I.D., Savitsky A.P. Oligomerization state of V127T SAASoti fluorescent protein at high concentrations. 3rd School on ADFLIM, Saratov State University, Saratov, September  24-28 http://www.adflim.org/ abstracts_proceedings.html
  • Savitsky A.P FRET for biochemical application: principles and mode of measurements. 3rd School on ADFLIM, Saratov State University, Saratov, September  24-28 http://adflim.org/files/ uploaded/ADFLIM321092018.pdf
  • Valery Tuchin, ”Optical clearing as a promising technique for in vivo optical imaging and treatment of hidden pathologies,”12th Workshop on Advanced Multiphoton and Fluorescence Lifetime Imaging Techniques FLIM2018” Conference in Berlin-Adlershof, Max-Born-Institute, June 15 — 16, 2018 (invited paper).
  • Valery V. Tuchin, “Optical clearing as a promising technology for in vivo laser diagnostics and treatment of hidden pathologies,” Advanced Laser Technologies (ALT’18), September 09-14, 2018, Tarragona, Spain (plenary paper).
  • Valery V. Tuchin «Biophotonics in Russia: main directions and development prospects» X International Conference «Basic Problems of Optics (BPO’18)», St. Petersburg October 15-19, 2018 (plenary paper).
  • Valery Tuchin, ”Tissue optical clearing as a platform for in vivo optical imaging and treatment of hidden pathologies: from UV to terahertz,” International Conference on Laser Applications in Life Sciences (LALS) in Israel, November 18-20, 2018, Bar-Ilan University, Israel (plenary paper).
  • Valery Tuchin, ”Tissue optics and optical clearing for functional imaging,” 30th International SAOT Workshop, Functional Optical Imaging in Medical Engineering, November 29 – 30, 2018, Friedrich-Alexander Universität Erlangen-Nürnberg, Germany (plenary paper).
  • Valery Tuchin, “Optical clearing of tissues in a broad spectral range from UV to THz,” International Conference on Bio Sensing and Imaging (ICOBSI), December 17-19, 2018, Palazzo Affari Firenze Fiera (invited paper).