5 ноября 1934 года на заседании Президиума АН СССР принято решение о реорганизации существовавшей в Академии наук с 1930 года Микробиологической лаборатории в Институт. Организатором и первым директором Института микробиологии был выдающийся советский микробиолог, заслуженный деятель науки РСФСР академик Г. А. Надсон (1867‒1939).
В этот первый год существования Института штат сотрудников насчитывал всего 12 человек (без директора, должность которого в эти годы числилась в штате Президиума АН вплоть до 1 января 1936 г.) и они все известны поименно:
| Директор | Надсон Георгий Адамович | 
Надсон Георгий Адамович |
| 1. Старший специалист, заместитель директора |
Бургвиц Георгий Константинович | |
| 2. Ученый секретарь | Раутенштейн Яков Исакович | |
| 3. Старший специалист | Зильбер Лев Александрович | |
| 4. Микробиолог | Вострухова Елена Ивановна | |
| 5. Микробиолог | Имшенецкий Александр Александрович | |
| 6. Микробиолог | Красильников Николай Александрович | |
| 7. Микробиолог | Мейсель Максим Николаевич | |
| 8. Микробиолог | Саенко Наталия Федотовна | |
| 9. Научный сотрудник 2-го разряда | Беляева Анна Петровна | |
| 10. Препаратор | Уткина Наталия Яковлевна | |
| 11. Завхоз | Бронфман Семен Матвеевич | |
| 12. Уборщица | Иончик Зинаида Ивановна |
В этом же 1934 году было принято решение о переводе Академии наук из Ленинграда в Москву, и многие институты, которые находились в стадии организации, в том числе Институт микробиологии, переехали в Москву. Переезд состоялся осенью 1934 г., и биологические институты и лаборатории расположились на Большой Калужской улице, ныне Ленинском проспекте, 33.
1935 год
В штате института 25 человек, в т.ч. научный персонал 19 чел., вот их имена и должности:
— заместитель директора ‒ он же старший микробиолог Бургвиц Г.К.
— ученый секретарь Раутенштейн Я.И.
— старший микробиолог Зильбер Л.А.
— ученые специалисты Красильников Н.А., Имшенецкий А.А., Вострухова Е.И., Туревич Е.И., Саенко Н.Ф., Мейсель М.Н., Кудрявцев В.И., Новогрудский Д.М.
— научные сотрудники 1-го разряда Муратова М.А., Рыбалкина А.В.
— научные сотрудники 2-го разряда Таусон Т.А., Боярская Б.Г., Солнцева Л.И., Кононенко Е.В., Беляева А.П.
— аспирантами были Литвинов М.А. и Крисс А.Е.
В структуре научных подразделений 4 отдела:
- Отдел бактерий (7 единиц),
- Отдел дрожжей (5 ед.),
- Отдел микобактерий и актиномицетов (2 ед.),
- Отдел ультрамикробов и фильтрующихся вирусов (4 ед.).
 Ученый совет Института микробиологии1934-1937 |
Зильбер Л.А. |
1937 год
29 октября 1937 года, в самый пик репрессий, академик Г.А. Надсон был арестован вместе со своим заместителем Бургвицем Г.К. по обвинению в участии в, так называемой, антисоветской диверсионно-вредительской организации. Приговором военной коллегии Верховного суда СССР от 14 апреля 1939 г. он был осужден к расстрелу. Приговор приведен в исполнение 15 апреля 1939 г. Сведений о месте захоронения не имеется. (Из документа, полученного чл.-корр. РАН И.А. Захаровым-Гезехусом в 1990 г. в ответ на обращение в КГБ с запросом относительно судьбы Г.А. Надсона). Реабилитирован Г.А. Надсон 29 октября 1955 г. (Записано со слов И.А. Захарова-Гезехуса на лекции, прочитанной им на заседании Ученого совета ИНМИ РАН 28 апреля 2004 г.).
1938 год
| Временно исполняющий обязанности директора, а затем директор Института ‒ чл.-корр. Академии наук Исаченко Борис Лаврентьевич.Заместитель директора ‒ Мейсель М.Н., ученый секретарь — Муратова М.А.
По штатному расписанию в Институте 79 человек, из них: научный персонал — 45 чел., научно-технический — 24 чел., младший обслуживающий — 5 чел. и адм.-хоз. — 5 чел.
В структуре Института 5 отделов (лабораторий):
Из Персональной ведомости к штатному расписанию на 1938 год следует, что в Старший научный персонал (23 чел.), кроме директора, заместителя директора, ученого секретаря и заведующих, входят старшие научные сотрудники (их имена приводятся ниже в порядке упоминания в ведомости): Красильников Н.А., Имшенецкий А.А., Буткевич В.С., Крисс А.Е., Мантейфель А.Я., Кудрявцев В.И., Лунц А.М., Раутенштейн Я.И., Баринова С.А., Назарова Т.С., Кондратьева Т.М., Литвинов М.А., Белозерский А.Н., Сухов К.С., Чумаков М.П., Дмитриевская Н.А. |
|
В группу Младший научный персонал (22 чел.) входят младшие научные сотрудники (также приводятся не по алфавиту, а в порядке их упоминания в ведомости): Егорова А.А., Иерусалимский Н.Д., Рыбалкина А.В., Худяков Я.П., Трофимова А.Н., Мельникова А.А., Кононенко Е.В., Нахимовская М.И., Агатов П.А., Солнцева Л.И., Таусон Т.А., Боярская Б.Г., Бехтерева М.Н., Гарнина Н.Р., Разницына Е.А., Смирнова В.А., Вовк А.М., Дратвина Т.В., Роганова О.П., Сироткина Н.И., Цыпина М.Г., Кореняко А.И.
Среди Научно-технического персонала (24 чел.) лаборанты Горюнова С.В., Чумак М.Л., Громыко Е.П. и др.
Докторанты Института: Стадниченко Н.Р. и Гольдин М.И.
1939 год
В двух штатных расписаниях, утвержденных 29 мая 1939 г. (Президентом АН СССР академиком В.Л. Комаровым) и 26 сентября 1939 г. (вице-президентом АН СССР академиком О.Ю. Шмидтом), числятся 69 человек. Из них: 42 (43) чел. — научный персонал, 18 (19) чел. — научно-технический персонал. Административно-хозяйственный и младший обслуживающий персонал — соответственно 5 и 4 чел.
1940 год
В штатном расписании на IV квартал 1940 года, утвержденном вице-президентом АН СССР академиком (подпись неразборчива) 18 декабря 1940 года — 71 человек. Научный персонал — 44, научно-технический — 21, адм.-хоз. — 5, младший обслуживающий персонал — 1 чел. (рабочий на станции).
Уже в предвоенные годы Институт микробиологии стал ведущим научным учреждением страны в области общей микробиологии, широко развернув работы по изучению фундаментальных проблем систематики, цитологии, генетики, биохимии и экологии различных групп микроорганизмов, а также по промышленной (технической), почвенной и водной микробиологии.
1941 год
В годы Великой Отечественной войны научная деятельность Института микробиологии в период 1941‒1943 гг. проходила в эвакуации (г. Фрунзе). Переезд Института в г. Фрунзе состоялся в сентябре-октябре 1941 года.
Директор Института – чл.-корр. АН СССР Исаченко Б.Л., зам. директора – к.б.н. Мейсель М.Н., ученый секретарь – Раутенштейн Я.И., затем к.б.н. Крисс А.Е.
Штатное расписание Института микробиологии АН СССР на 1941 год утверждено вице-президентом АН СССР 26 апреля 1941 г. Штат определен в количестве 72 человек. Но есть и другое штатное расписание на 1941 год, которое составлено во втором полугодии 41-го года, когда уже шла война. Вот информация из этого документа: Количество штатных единиц ‒ ВСЕГО ‒ 48 (научный персонал ‒ 30, в том числе 4 зав. отделами и 1 зам. зав. отделом; научно-технический персонал ‒ 15; адм. хозяйств. персонал ‒ 3), включая ‒ 1 ст. н. сотрудника и 1 лаборанта в истребительном батальоне.
1942 год
Ученому Совету Института Микробиологии присвоено право присуждать ученые степени (поддержано Президиумом Академии Наук СССР на заседании от 25 августа 1942 г. и направлено в ВКВШ). Тем не менее, из архивных документов следует, что, начиная с момента создания Института, подготовка специалистов через аспирантуру и докторантуру проводилась: в 1935 г. аспирантами были Литвинов М.А. и Крисс А.Е.; в 1938 г. докторантами числились Стадниченко Н.Р. и Гольдин М.И.; в 1942 г. — аспирант Алексеева Т.С., докторант Березова Е.Ф.
В 1941-1942 гг. сотрудники Института проводили научные исследования и выезжали в командировки и экспедиции в рамках тем:
- Использование в производственных условиях ферментативных препаратов из термофильных бактерий. Пуск производственной установки по промышленному получению супербиолазы.
- Внедрение новых видов сырья и участие в пуске ацетонового завода (в Грозном и на Урале).
- Микробиологические методы обогащения пищевых продуктов витаминами группы В. Полупроизводственные и заводские опыты на хлебокомбинате в Пишпеке.
- Разработка основных принципов применения бактериальных удобрений. Постановка опытов в колхозах и наблюдение за бактеризацией и посевами.
- Микробиологические методы борьбы с вилтом хлопчатника в Узбекской и Таджикской ССР.
- Опыты по использованию отходов (силосования ботвы) сахарной свеклы.
- Применение и разработка новых методов борьбы с закукливанием злаков (Западная Сибирь, Башкирия).
- Разработка метода борьбы с вирусными поражениями люцерны (Башкирия).
- Испытание, усовершенствование и внедрение микробиологических препаратов для заживления ран (для работы в госпиталях).
- Разработка методов получения активных препаратов сухих и очищенных бактериофагов (для проверочной работы в госпитале).
- Очистка сточных вод (обесфеноливание).
- Полевые работы. Подготовка и обработка полевых участков для постановки опытов по применению бактериальных удобрений.
1943 год
Научно-исследовательская работа Института в 1943 году была сосредоточена на выполнении 20 научных и научно-практических тем, сгруппированных вокруг следующих проблем:
- Микробиологические методы рационализации и ускорения промышленных процессов и производств.
- Микробиологические методы повышения урожайности сельскохозяйственных культур и борьба с поражениями культурных растений.
- Условия образования и механизм действия витаминов, ростовых и лизирующих веществ микробного происхождения.
- Микробиология нефти, пластовых и сточных вод.
В 1943 году проведена интенсивная работа по внедрению результатов исследований в промышленность (химическую, пищевую и текстильную), в военно-санитарные учреждения и в сельское хозяйство. Эти работы потребовали привлечения, наряду со штатными сотрудниками, временного научно-технического персонала для учета результатов применения разработанных методов в заводских условиях, госпиталях и на полевых опытных участках.
В 1943 году Институт вернулся а Москву из эвакуации. В течение 1941‒1943 гг. оборудование Института подверглось троекратной перевозке на дальние расстояния, хранилось и эксплуатировалось в обстановке эвакуации в мало подходящих условиях и, вследствие этого, значительная его часть нуждалась в капитальном ремонте. Особенно пострадало оборудование, находившееся в Москве. Несмотря на сложные условия, в Институте проходили подготовку десять аспирантов (докторантов и кандидатов).
1944 год
Институт Микробиологии в 1944 г. решал следующие задачи в научной и научно-организационной деятельности:
- Увеличение удельного веса работ по исследованию деятельности и роли микроорганизмов в природных условиях (с командировками сотрудников в районы серных и нефтяных месторождений, в места селитрообразования и обитания термофильных бактерий) с проведением многочисленных химических анализов.
- Расширение испытаний и внедрения разработанных в Институте медико-биологических препаратов, витаминных концентратов и ферментативных препаратов для текстильной промышленности.
- Расширение полевых опытов с новыми бактериальными удобрениями, по биологическому оструктуриванию почв и по испытанию предлагаемых методов в разных районах.
1945 год
В 1945 году в штате Института числился 51 человек, в том числе 30 научных сотрудников, в структуре ‒ 4 крупных отдела (Отдел общей микробиологии, Отдел почвенной микробиологии, Отдел вирусов растений, Отдел бродильных организмов).
В этот период Институт испытывал особый кадровый дефицит младшего технического персонала – препараторов, в то время как лаборанты, особенно старшие, обладали такой степенью квалификации, что принимали участие в постановке и проведении экспериментальных работ (часть ст. лаборантов с высшим образованием). Недостаточное обеспечение касалось очень трудоёмкого участка — приготовление и стерилизация микробиологической посуды и сред, уход за опытными посадками и обслуживание хранилища живых культур микроорганизмов.
ИНСТИТУТ МИКРОБИОЛОГИИ В ГОДЫ ВОЙНЫ
С 1939 по 1948 годы Институт микробиологии возглавлял академик АН СССР и АН УССР Б.Л. Исаченко (1871‒1948), крупный специалист в области общей микробиологии и экологии микроорганизмов, с именем которого связаны пионерские работы по морской и геологической микробиологии, заложившие основы понимания роли микроорганизмов в круговороте веществ в биосфере.
1949 — 1984 годы
| В 1949 году директором Института был назначен чл.-корр. АН СССР А.А. Имшенецкий, избранный в действительные члены АН СССР в 1962 г. На этом посту Герой Социалистического Труда академик А.А. Имшенецкий оставался в течение 35 лет (до 1984 г.). Именно в этот период сформировался коллектив Института, определились основные направления его научной и научно-организационной деятельности.Традиционными основными направлением научной деятельности ИНМИ является изучение многообразия микробного мира и систематики микроорганизмов, эколого-геохимические исследования и работа по технической (промышленной) микробиологии в качестве важной составной части в биотехнологию.
Изучение многообразия мира микроорганизмов развивалось в нескольких направлениях. Мировое признание получили результаты фундаментальных исследований чл.-корр. АН СССР Н.А. Красильникова, разработавшего основы систематики актиномицетов, что позволило вести целенаправленный поиск продуцентов антибиотиков. Профессором В.И. Кудрявцевым проведено всестороннее изучение спорообразующих дрожжей и созданы основы систематики этой группы микроорганизмов.
Большое внимание уделялось физиолого-биохимическим исследованиям, а также экологии и систематике различных специализированных групп микроорганизмов. В разных отделах Института выделены и подробно изучены представительные коллекции азотфиксирующих, водородных, метанообразующих, фотосинтезирующих, сульфатредуцирующих, тионовых бактерий, карбоксидобактерий, железобактерий, олиготрофных микроорганизмов. |
Имшенецкий Александр Александрович |
В 1971 г. Госкомитетом Совета Министров СССР по делам изобретений и открытий зарегистрировано открытие микроорганизма, использующего в качестве энергетического источника для хемосинтеза окисление соединений сурьмы (Д.б.н. Н.Н. Ляликова-Медведева).
Большой общебиологический интерес представляют исследования микроорганизмов, развивающихся в экстремальных условия окружающей среды: термофильных, галофильных и ацидофильных (отделы докт. биол. наук Л.Г. Логиновой, Г.И. Каравайко, В.К. Плакунова, чл.-корр. АН СССР Г.А. Заварзина).
Наряду с изучением представителей различных групп бактерий, микроскопических грибов и актиномицетов в работах ряда ведущих ученых ИНМИ большое внимание уделялось также исследованию вирусов и вызываемых ими болезней растений (чл.-корр. АН СССР В.Л. Рыжков) и изучению явлений фаголизиса промышленных культур различных микроорганизмов (докт. биол. наук Я.И. Раутенштейн). Успешно развивался ряд разделов молекулярной вирусологии, исследования механизмов функционирования и репликации вирусов растений (академик ВАСХНИЛ И.Г. Атабеков).
чл.-корр. АН СССР В.Л. Рыжков |
академик И.Г. Атабеков |
академик Г.А. Заварзин |
Широко известны как у нас в стране, так и за рубежом работы по экологии микроорганизмов, выполненные в разные годы академиками Б.Л. Исаченко и Е.Н. Мишустиным, чл.-корр. АН СССР С.И. Кузнецовым, докт. биол. наук. А.Е. Криссом·и их многочисленными учениками. В ходе этих исследований детально изучено распространение микроорганизмов в различных типах почв, в озерах и водохранилищах, а также в водной толще и донных осадках Мирового океана. Жизнеспособные клетки микроорганизмов обнаружены в кернах материкового льда Антарктиды, причем время консервации микроорганизмов в антарктических льдах составляет не менее 12 тыс. лет (канд. биол. наук С.С. Абызов). Исследованиями академика Е.Н. Мишустина и его сотрудников на количественной основе оценена роль свободноживущих и симбиотических азотфиксаторов в снабжении почвы биологическим азотом.
академик Е.Н. Мишустин |
чл.-корр. АН СССР С.И. Кузнецов |
докт. биол. наук. А.Е. Крисс |
В отделе, возглавляемом академиком А.А. Имшенецким, большое внимание уделялось изучению проблем экзобиологии: исследовано влияние на микроорганизмы факторов, характерных для космического пространства, а также экологических условий, моделирующих марсианские.
Наряду с эколого-географическим направлением в работах сотрудников Института микробиологии успешно развивались эколого-геохимические исследования, главной задачей которых является выявление роли микроорганизмов в круговороте веществ в биосфере.
| Сотрудниками школы чл.-корр. АН СССР С.И. Кузнецова детально исследована роль микроорганизмов в круговороте основных биогенных элементов (углерод, кислород, сера и азот) и некоторых металлов во внутренних водоемах, а также в процессах образования, видоизменения и разрушения различных месторождений полезных ископаемых: сульфидные и марганцевые руды, осадочные и вулканогенные месторождения самородной серы, нефтегазовые месторождения. На основе этих работ оценена роль микроорганизмов в процессах рудообразования и миграции элементов в зоне гипергенеза (докт. биол. наук Г.А. Дубинина и докт. биол. наук Н.Н. Медведева, чл.-корр. АН СССР М.В. Иванов, канд. биол. наук Е.П. Розанова) и созданы научные основы новой для СССР области биотехнологии ‒ бактериальной гидрометаллургии (докт. биол. наук Г.И. Каравайко).
Крупным разделом научно-исследовательской деятельности Института является изучение функциональной морфологии и цитологии микроорганизмов. В течение многих лет это направление возглавляет чл.-корр. АН СССР М.Н. Мейсель, в работах которого детально изучена структурная организация микроорганизмов, а также расшифрованы механизмы воздействия на микробную клетку ионизирующих излучений, канцерогенных веществ, углеводородов, гербицидов и ряда других соединений. В последние годы цитологические исследования развернуты и в других отделах Института и распространены на такие малоизученные группы бактерий, как олиготрофные микроорганизмы, архебактерии и фототрофы. |
член-корр. РАН Г.И. Каравайко |
Совместными усилиями цитологов и биохимиков изучен новый механизм саморегуляции роста, развития и клеточной дифференциации бактерий и, в частности, перехода клеток в анабиотическое состояние. Специфическими регуляторами этих процессов являются мембраноактивные соединения, относящиеся к алкилоксибензолам (докт. биол. наук В.И. Дуда, канд. биол. наук Г.И. Эль-Регистан).
С самых первых лет организации Института в нем были широко развернуты работы по микробной биотехнологии. Разработанная академиком В.Н. Шапошниковым на примере ацетоно-бутилового брожения концепция двухфазности была не только подтверждена при изучении большого числа других микробиологических процессов, но и явилась основой для организации в СССР промышленного получения ацетона и бутанола (академики В.Н. Шапошников, Н.Д. Иерусалимский, докт. биол. наук М.Н. Бехтерева). Многолетние исследования чл.-корр. АН СССР Н.А. Красильникова по всестороннему изучению актиномицетов легли в основу отечественной промышленности антибиотиков как медицинского, так и сельскохозяйственного назначения.
академик В.Н. Шапошников |
докт. биол. наук М.Н. Бехтерева |
чл.-корр. АН СССР Н.А. Красильников |
Академик Н.Д. Иерусалимский явился пионером разработки в СССР научных основ непрерывного культивирования микроорганизмов и внедрения этого прогрессивного способа как в исследовательскую работу, так и в промышленность. Большой вклад в исследование физиологических основ лимитирования и ингибирования роста микроорганизмов при непрерывном культивировании был сделан докт. биол. наук И.Л. Работновой.
Сотрудники Института (академики Г.К. Скрябин и Н.Д. Иерусалимский, чл.-корр. АН СССР М.Н. Мейсель) приняли активное участие в разработке научных основ промышленного получения дрожжевого белка на углеводородах нефти. Работы по получению микробного белка проводились также в отделе чл.-корр. АН СССР Г.А. Заварзина и были направлены на выделение и детальное исследование культур водородокисляющих микроорганизмов.
академик Г.К. Скрябин |
академик Н.Д. Иерусалимский |
чл.-корр. АН СССР М.Н. Мейсель |
Из других крупных биотехнологических разработок сотрудников Института, уже внедренных в промышленность, необходимо упомянуть об исследованиях по микробной трансформации стероидов, которые явились научной основой для организации в СССР производства преднизона и других стероидов (академик Г.К. Скрябин), и о работах докт. биол. наук М.Н. Бехтеревой и докт. биол. наук В.Д. Кузнецова, которые завершились промышленным производством в СССР кормового препарата микробиологического β-каротина.
Большое внимание уделено поиску активных продуцентов ферментов. В отделе академика А.А. Имшенецкого выделены и изучены продуценты ферментных препаратов, представляющих интерес для медицины: холестериноксидазы и препарата террилитина, выпускаемого в промышленном масштабе и применяющегося для лечения гнойных ран и ожогов.
В отделе докт. биол. наук Л.Г. Логиновой исследован ряд ферментов термофильных микроорганизмов: сериновая и другие протеиназы, амилазы, целлюлазы, ксиланазы, щелочные фосфатазы. Они также представляют интерес для медицины и сельского хозяйства. Кроме того, в Институте большое внимание уделялось микробному синтезу липидов; выделены продуценты арахидоновой и других незаменимых жирных кислот — предшественников простагландинов (докт. биол. наук М.Н. Бехтерева и докт. биол. наук Ю.Н. Карасевич). Таким образом, одним из важнейших направлений исследований в ИНМИ является разработка научных основ биосинтеза микроорганизмами веществ, представляющих интерес для народного хозяйства.
Наряду с научной деятельностью Институт микробиологии АН СССР проводил большую научно-организационную работу. В 1956 rоду по инициативе Института было создано Всесоюзное микробиологическое общество при Академии наук СССР, в рядах которого объединились микробиологи как академических институтов и высших учебных заведений, так и работники предприятий различных отраслей промышленности, использующих микроорганизмы (в 2004 г. Всесоюзное микробиологическое общество было преобразовано в Межрегиональную общественную организации «Микробиологическое общество»).
По инициативе ИНМИ была создана Всесоюзная коллекция культур микроорганизмов, ставшая ныне ценным микробным фондом страны. Наконец, ИНМИ послужил базовой организацией для создания второго крупного микробиологического института Академии наук СССР ‒ Института биохимии и физиологии микроорганизмов, входящего в состав Научного центра биологических исследований в Пущино. В области международных научных связей ИНМИ имеет прочные творческие контакты с микробиологическими институтами академий наук зарубежных стран, ученые Института неоднократно представляли результаты своих исследований на самых представительных международных научных форумах, а в 1966 года ИНМИ был одним из организаторов Международного конгресса микробиологов в Москве.
БУКЛЕТ «ИНСТИТУТ МИКРОБИОЛОГИИ 1934-1984»
(Ответственный редактор д.б.н. Г.И. Каравайко, издательство «НАУКА», 1984)
| 1984 — 1990 годы
С назначением в 1984 году на должность директора ИНМИ АН СССР чл.-корр. АН СССР М.В. Иванова структура института была изменена, ряд отделов были выведены из структуры, другие преобразованы в лаборатории.
Иванов Михаил Владимирович – советский и российский микробиолог, специалист в области микробной биогеохимии и биогеотехнологии. Директор Института микробиологии (1984‒2003).
М.В. Ивановым и его сотрудниками были выполнены исследования, позволившие сформировать направление «Микробная биогеохимия». Большую известность получили работы по изучению роли микроорганизмов в образовании и разрушении месторождений самородной серы. М.В. Ивановым и его учениками обоснована концепция нового раздела биотехнологии – биогеотехнологии – и разработаны принципиально новые технологии использования микроорганизмов при добыче полезных ископаемых, которые прошли промышленную проверку на шахтах Донбасса и Кузбасса и на нефтепромыслах Татарстана и Китая.
С 15 марта 1985 г. в структуру института входили (штатная численность по 1986 г.): |
 Иванов Михаил Владимировичакадемик директор Института микробиологии с 1984 по 2003 гг. |
СТРУКТУРА ИНМИ РАН в 1985 г.
| № | № | Наименование структурных подразделений | Руководитель структурного подразделения | Нормативная численность сотрудников |
|
ОТДЕЛЫ |
||||
| 1 | Отдел геомикробиологии и биогеотехнологии | чл.-корр. АН СССР Иванов М.В. | 42 | |
| 1 | Лаборатория микробной биогеохимии | чл.-корр. АН СССР Иванов М.В. | 10 | |
| 2 | Лаборатория биогеотехнологии металлов (объединение отделов микробиологии горных пород и физиологии и биохимии термофильных микроорганизмов) | Д.б.н. Г.И. Каравайко | 17 | |
| 3 | Лаборатория геохимической деятельности микроорганизмов | чл.-корр. АН СССР С.И. Кузнецов | 15 | |
| 2 | Отдел почвенных микроорганизмов | Академик Е.Н. Мишустин | 32 | |
| 4 | Лаборатория микробных сообществ почв | Академик Е.Н. Мишустин | 20 | |
| 5 | Лаборатория олиготрофных микроорганизмов | д.б.н. Д.И. Никитин | 12 | |
|
ЛАБОРАТОРИИ |
||||
| 6 | Лаборатория физиологии и биохимии гетеротрофных микроорганизмов | д.б.н. Ю.Н. Карасевич | 26 | |
| 7 | Лаборатория цитологии микроорганизмов (объединение отделов сравнительной цитологии микроорганизмов и физиологии спорообразующих бактерий) | д.б.н. В.И. Дуда | 17 | |
| 8 | Лаборатория литотрофных микроорганизмов | чл.-корр. АН СССР Г.А. Заварзин | 18 | |
| 9 | Лаборатория физиологии мутантов микроорганизмов | Академик А.А. Имшенецкий | 29 | |
| 10 | Лаборатория регуляции микробного метаболизма | д.б.н. В.К. Плакунов | 19 | |
| 11 | Лаборатория общей и сравнительной вирусологии | Академик ВАСХНИЛ И.Г. Атабеков | 16 | |
| 12 | ГРУППЫ ПРИ ДИРЕКЦИИ | |||
| Группа систематики и физиологии актиномицетов | д.б.н. В.Д. Кузнецов | 6 | ||
| Группа морской микробиологии | д.б.н. И.Е. Мишустина | 5 | ||
| Итого по научно-исследовательским подразделениям 183 | ||||
Научные направления исследований Института микробиологии (1986-1990 гг.):
- Систематика и эволюция микроорганизмов.
- Цитология и цитохимия микроорганизмов.
- Физиология микроорганизмов.
- Биохимия микроорганизмов.
- Физиолого-биохимические основы использования микроорганизмов.
- Почвенная и сельскохозяйственная микробиология.
- Экология микроорганизмов и биогеохимия.
- Вирусы и фаги.
- Микроорганизмы и биотопливо.
- Биогеотехнология.
- Средства диагностики вирусных и бактериальных болезней.
- Биологически активные соединения для нужд сельского хозяйства.
1990 год
В 1990 году расформирован отдел геомикробиологии и биогеотехнологии, включавший три лаборатории (лаб. геохимической деятельности микроорганизмов, лаб. микробной биогеохимии и лаб. биогеотехнологии металлов), с сохранением в структуре Института этих лабораторий как самостоятельных научных подразделений. Группа морской микробиологии включена в состав лаборатории микробной биогеохимии. По состоянию на окончание 1990 г. в структуре ИНМИ находились:
СТРУКТУРА ИНМИ РАН в 1990 г.
| № | Наименование структурных подразделений | Руководитель структурного подразделения | Численность сотрудников на 01.01.1990 |
| ЛАБОРАТОРИИ | |||
| 1 | Микробной биогеохимии | Академик М.В. Иванов | 20 |
| 2 | Микробной трансформации минералов | Д.б.н. Г.И. Каравайко (с 15.12.1990 — чл.-корр.) |
15 |
| 3 | Микробных сообществ | Чл.-корр. АН СССР Г.А. Заварзин | 20 |
| 4 | Общей и сравнительной вирусологии | Чл.-корр. АН СССР, акад. ВАСХНИЛ И.Г. Атабеков | 13 |
| 5 | Экологии и геохимической деятельности микроорганизмов | Д.б.н. В.М. Горленко | 12 |
| 6 | Олиготрофных микроорганизмов | Д.б.н. Д.И. Никитин | 15 |
| 7 | Почвенной микробиологии | Д.б.н. Н.С. Паников | 9 |
| 8 | Регуляции микробного метаболизма | Д.б.н. В.К. Плакунов | 15 |
| 9 | Цитологии микроорганизмов | Д.б.н. В.И. Дуда | 16 |
| 10 | Генной систематики и эволюции бактерий (в 1989-1990 гг. — лаборатория Генетики бактерий; заведующий — д.б.н. К.М. Чумаков) | К.б.н. Е.В. Кунин | 12 |
| 11 | ГРУППЫ ПРИ ДИРЕКЦИИ: | ||
| Микробиологии синтетических соединений | Д.б.н. Ю.Н. Карасевич | 4 | |
| Систематики и физиологии актиномицетов | Д.б.н., проф. В.Д. Кузнецов | 5 | |
| Культивирования микроорганизмов | К.б.н. М.П. Ховрычев | 7 | |
| 12 |
ГРУППЫ СОВЕТНИКОВ: | ||
| Группа советника | Академик А.А. Имшенецкий | 4 | |
| Группа советника | Академик Е.Н. Мишустин | 8 | |
| 13 | ВРЕМЕННЫЕ НАУЧНЫЕ КОЛЛЕКТИВЫ: | ||
| ВНК «Физиологии продуцентов биологически активных липидов» | К.б.н. И.В. Конов | 8 | |
| ВНК «Цитодифференцировки и липидообразования мицелиальных грибов» | Д.б.н. Е.П. Феофилова | 5 | |
1996 год
В 1996 год (пр. № 45к от 15 марта 1996 г.) в составе научных подразделений ИНМИ находились:
СТРУКТУРА ИНМИ РАН в 1996 г.
| № | № | Наименование структурных подразделений | Руководитель структурного подразделения |
| ОТДЕЛЫ | |||
| 1 | Отдел микробной биогеохимии и биогеотехнологии | академик Иванов М.В. | |
| 1 | Лаборатория микробиологии и биогеохимии водоемов | академик Иванов М.В. | |
| 2 | Лаборатория нефтяной микробиологии | д.б.н., проф. С.С. Беляев | |
| 2 | Отдел микробных сообществ | чл.-корр. РАН Г.А. Заварзин | |
| 4 | Лаборатория реликтовых микробных сообществ | чл.-корр. РАН Г.А. Заварзин | |
| 5 | Лаборатория гипертермофильных микробных сообществ | д.б.н. Бонч-Осмоловская Е.А. | |
| Лаборатория микробиологии антропогенных местообитаний (выведена из состава Отдела 10 октября 2001 г.) | д.б.н. Ножевникова | ||
| ЛАБОРАТОРИИ | |||
| 6 | Лаборатория хемолитотрофных микроорганизмов | чл.-корр. РАН Каравайко Г.И. | |
| 7 | Лаборатория экологии и геохимической деятельности | д.б.н., проф. Горленко В.М. | |
| 8 | Лаборатория почвенной микробиологии и биокинетики (выведена из структуры 29 марта 2002 г. пр. № 80к) | д.б.н., проф. Паников Н.С. | |
| 9 | Лаборатория вирусологии | к.б.н. Чирков С.Н. | |
| 10 | Лаборатория классификации и хранения уникальных микроорганизмов | д.б.н. Гальченко В.Ф. (с 1997 г. — чл.-корр. РАН) | |
| Группа систематики и физиологии актиномицетов | д.б.н., проф. Кузнецов В.Д. | ||
| Группа олиготрофных микроорганизмов | д.б.н. Никитин Д.И. | ||
| Группа ауторегуляции микробных процессов | д.б.н. Эль-Регистан Г.И. | ||
| Группа цитологии микроорганизмов | к.б.н. Поглазова М.Н. | ||
| Группа геносистематики бактерий | к.б.н. Турова Т.П. | ||
| Группа метанотрофов | д.б.н. Гальченко В.Ф. (с 1997 г. — чл.-корр. РАН) | ||
| 11 | Лаборатория экспериментальной микологии | д.б.н., проф. Феофилова Е.П. | |
| Группа цитодифференцировки и липидообразования мицелиальных грибов | д.б.н., проф. Феофилова Е.П. | ||
| Группа физиологии продуцентов биологически активных липидов | к.б.н. Конова И.В. | ||
2003 год
| С марта 2003 г. по 31.12.2015 г. директором ИНМИ РАН являлся чл.-корр. РАН Гальченко Валерий Федорович.
Валерий Фёдорович Гальченко, как видный ученый-микробиолог, внес достойный вклад в развитие российской биологической науки. Он известен как один из ведущих специалистов России в области изучения метанокисляющих бактерий, исследования биогеохимических и микробиологических процессов в морских и озерных экосистемах, в т.ч. в глубоководных морских гидротермах и озерах Антарктиды. В ходе многочисленных экспедиций он создал коллекцию уникальных метанокисляющих бактерий. Прикладной аспект работ в области метанотрофии был направлен на применение метанотрофов для удаления метана из угольных шахт, а также биотехнологическое производство микробного белка на основе утилизации метана. Валерий Федорович ‒ участник 33 международных морских, антарктических и арктических экспедиций (1980-2015). Именно им выполнены пионерские комплексные физико-химические, микробиологические и биогеохимические исследования 39 озер Арктики и Антарктики, предложено обоснование и доказана роль метанотрофных бактерий в питании беспозвоночных животных морских глубоководных гидротерм.
В.Ф. Гальченко — признанный в стране и за рубежом специалист в области микробной экологии, биогеохимии, физиологии микроорганизмов. Он автор и соавтор более 200 научных работ, трёх монографий, 4 патентов на изобретение РФ. В 2003 г. Валерий Федорович стал лауреатом премии РАН им. С.Н. Виноградского. За выдающиеся достижения в изучении микробной биогеохимии океана он был награжден юбилейной медалью «300 лет Российскому флоту» (1996), а его вклад в исследования Антарктиды был отмечен медалью Конгресса США (2002). |
 Гальченко Валерий Федоровиччлен-корреспондент РАН директор Института микробиологии с 2003 по 2015 гг. |
2004 год
Научные направления ИНМИ РАН в 2004-2014 гг.:
(Утверждены Постановлением Президиума РАН от 10 февраля 2004 г. № 42)
- биоразнообразие микроорганизмов, создание и пополнение коллекций чистых культур микроорганизмов;
- физиология и биохимия микроорганизмов;
- экология микроорганизмов и биогеохимия;
- молекулярная биология вирусов микроорганизмов;
- использование микроорганизмов в биотехнологии.
ИНМИ РАН – 70 лет (НАУЧНЫЕ ПОДРАЗДЕЛЕНИЯ ИНМИ РАН ПО СОСТОЯНИЮ НА 2004 г.)
Сотрудники Института микробиологии
2004 год
2006 год
СТРУКТРА ИНМИ РАН В 2006 году
(утверждена приказом директора № 35 29.12.2006 г. на основании приказа директора № 45к от 15 марта 1996 г. с учетом последующих частичных изменений организационной структуры, принятых на основании решений Ученого совета: от 10.10.2001, протокол № 5; 14.12.2001, протокол № 10; 18.04.2002, протокол № 4; 11.06.2003, протокол № 9; и утвержденных приказами директора № 362к от 20.12.2001; № 80к от 29.03.2002; № 245к/а от 04.09.2002; № 193к от 04.06.2003; № 90к от 24.03.2003; № 218к от 20.06.2003; № 66к от 01.03.2006)
| № | № | Наименование структурных подразделений | Руководитель структурного подразделения | Нормативная численность сотрудников |
| ОТДЕЛЫ | ||||
| 1 | Отдел микробной биогеохимии и биогеотехнологии | Академик Иванов М.В. | 27 | |
| 1 | Лаборатория микробиологии и биогеохимии водоемов | Академик Иванов М.В. | 13 | |
| 2 | Лаборатория нефтяной микробиологии | Д.б.н., проф. Беляев С.С. | 14 | |
| 2 | Отдел микробных сообществ | Академик Заварзин Г.А. | 26 | |
| 3 | Лаборатория реликтовых микробных сообществ | Академик Заварзин Г.А. | 15 | |
| Группа для выполнения работ по Программе Президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология» (с 2006 г.) | Д.б.н. Дедыш С.Н. | 4 | ||
| 4 | Лаборатория гипертермофильных микробных сообществ | Д.б.н. Бонч-Осмоловская Е.А. | 11 | |
| ЛАБОРАТОРИИ | ||||
| 5 | Лаборатория классификации и хранения уникальных микроорганизмов | Чл.-корр. РАН Гальченко В.Ф. | 17 | |
| Группа систематики и физиологии актиномицетов | К.б.н. Филиппова С.Н. | 1 | ||
| Группа олиготрофных микроорганизмов | Д.б.н., проф. Никитин Д.И. | 1 | ||
| Группа ауторегуляции микробных процессов | Д.б.н., проф. Эль-Регистан Г.И. | 4 | ||
| Группа цитологии микроорганизмов | Сорокин В.В. | 2 | ||
| Группа геносистематики бактерий | К.б.н. Турова Т.П. | 1 | ||
| Группа метанотрофов | Чл.-корр. РАН Гальченко В.Ф. | 8 | ||
| 6 | Лаборатория экологии и геохимической деятельности микроорганизмов | Засл. деятель науки РФ, д.б.н., проф. Горленко В.М. | 10 | |
| 7 | Лаборатория хемолитотрофных микроорганизмов | Д.б.н. Кондратьева Т.Ф. (с 2006 г.) | 8 | |
| 8 | Лаборатория микробиологии антропогенных местообитаний | Д.б.н. Ножевникова А.Н. | 5 | |
| 9 | Лаборатория вирусов микроорганизмов (образована в 2003 г. из лаб. вирусологии) | К.б.н. Летаров А.В. | 4 | |
| 10 | Лаборатория экспериментальной микологии | Засл. деятель науки РФ, д.б.н., проф. Феофилова Е.П. | 6 | |
| Группа физиологии продуцентов биологически активных липидов | 2 | |||
| Группа цитодифференцировки и липидообразования мицелиальных грибов | 4 | |||
| Итого по научно-исследовательским подразделениям 103 | ||||
Наиболее важные научные достижения ИНМИ РАН, вошедшие в Отчетные доклады Президиума РАН (2002-2006 гг.):
- Изучение биоразнообразия микроорганизмов экстремальных местообитаний позволило открыть 22 новых рода и 50 новых видов микроорганизмов. Среди них гипертермофилы, психрофилы, алкалофилы, галофилы, метанотрофы, метаногены, фототрофы и серобактерии. Их местообитанием являются гидротермы, содовые озера, болота, ультрапресные экосистемы Сибири, Заполярья, Африки, США и Монголии. Выделенные микроорганизмы ответственны за окисление углеводородов, закисного железа, серы, сульфидных минералов, водорода, восстановление оксидов азота и сульфатов. Эти организмы обеспечивают круговорот веществ в экстремальных условиях среды обитания и используются во многих биотехнологических процессах (биотехнологии повышения нефтеотдачи, переработки золото-мышьяковых концентратов в промышленных условиях, получении термостабильных ферментов, очистке низкоактивных радиоактивных отходов и др.).
- В результате системного подхода к анализу биоразнообразия микроорганизмов содовых озер как модели внутриконтинентальной экосистемы получена ранее отсутствовавшая целостная картина метаболических взаимоотношений в алкалофильном сообществе, начиная с фотосинтезирующих цианобактерий и заканчивая анаэробными микробами-деструкторами, что позволило придать новый аспект глобальному процессу углекислотного выветривания на Земле. Получены весомые доказательства научной гипотезы о том, что современные алкалофильные сообщества микроорганизмов могут являться аналогами субаэральных наземных экосистем протерозоя.
- Описан новый порядок Nautiliales, представляющий рано обособившуюся филогенетическую ветвь в классе Proteobacteria. Его представители широко распространены в гидротермах и являются поставщиками органического углерода для червей-полихет — эндемиков глубоководных гидротерм. Выделение представителей нового порядка Nautiliales, в который входят литоавтотрофные микроорганизмы, использующие энергию молекулярного водорода и углерод углекислого газа гидротермального происхождения, разрушает миф о некультивируемости экологически значимых прокариот и объясняет их роль в экосистеме. Предложена полная расшифровка уникальной трофической цепи, не зависящей от солнечной энергии.
- Описан новый класс Thermolithobacteria с новыми семейством, родом и двумя видами, представленный анаэробными термофильными хемолитоавторофными бактериями, окисляющими СО или водород.
- Составлен баланс микробных процессов образования и окисления метана в анаэробной зоне Черного моря. Установлено, что годовая величина анаэробного окисления метана значительно превышает его продукцию, а дефицит метана покрывается за счет поступления из грязевых вулканов и холодных метановых сипов континентального склона. Оценена продукция биогенного метана в верхнем слое осадков и показано, что часть этого метана участвует в образовании кристаллогидратов в глубоководных донных осадках, где имеются благоприятные для этого термобарические условия. Экспериментально показана важная роль метанобразующих архей в анаэробных микронишах аэробной зоны (кишечник зоопланктона, пеллеты и другие органоминеральные микроагрегаты) в формировании потока метана в атмосферу с акватории Черного моря.
- Разработана система олигонуклеотидных праймеров для амплификации и сиквенса всех типов и форм гена рибулозобисфосфаткарбоксилазы (RubisCo) из геномов различных автотрофных эубактерий. Проведены исследования по выявлению и секвенированию генов этого фермента у фото-, хемо- и метанотрофов. На основании анализа генов 16S рРНК, а также некоторых функциональных генов были проведены молекулярно-экологические исследования филогенетического разнообразия прокариот в многочисленных экосистемах с экстремальными физико-химическими условиями Эспериментально подтверждена перспективность использования генов nifH в качестве филогенетических маркеров при проведении молекулярно-экологических исследований и идентификации диазотрофов природных сообществ (вплоть до видового уровня).
- Установлена ведущая роль умеренно-термофильных бактерий рода Sulfobacillus, архей рода Ferroplasma и ряда других в окислении сульфидных минералов и извлечении золота. В условиях реального промышленного производства реализована биогидрометаллургическая (микробиологическая) технология переработки сложных золото-мышьяковых сульфидных концентратов, получаемых из обедненной золотосодержащей руды Олимпиадинского месторождения (Красноярский край). В течение 2003-2004 гг. данным методом получено 25 тонн золота (ИНМИ РАН совместно с ЗАО ЗДК «Полюс», ЦНИГРИ).
- Показана роль электрофизических и кристаллохимических свойств отдельных минералов, входящих в состав руд или концентратов, а также штаммового полиморфизма ацидофильных хемолитотрофных микроорганизмов, обусловленного наличием IS элементов, в биогидрометаллургических технологиях. Получены новые данные о роли IS-элементов в процессах адаптации микроорганизмов к новым энергетическим субстратам.
- Завершены опытно-промышленные испытания разработанной в Институте микробиологии им. С.Н.Виноградского РАН биотехнологии переработки нефтегазоносных пластов, основанной на активации жизнедеятельности пластовой микрофлоры, на высокотемпературном (60оС) месторождении Даган (КНР). На экспериментальном участке получено около 30 тыс. тонн дополнительной нефти при пятикратной окупаемости вложений.
Структура научных подразделений ИНМИ РАН в 2006-2012 гг.
| № | № | Наименование структурных подразделений | Руководитель структурного подразделения | Нормативная численность сотрудников |
| ОТДЕЛ | ||||
| 1 | Отдел микробной биогеохимии и биогеотехнологии | Академик Иванов М.В. | ||
| 1 | Лаборатория микробиологии и биогеохимии водоемов | Академик Иванов М.В. | 13 | |
| 2 | Лаборатория нефтяной микробиологии | Д.б.н., проф. Беляев С.С. | 13 | |
| ЛАБОРАТОРИИ | ||||
| 3 | Лаборатория выживаемости микроорганизмов (название изменено пр. № 189л от 30.06.2011 г.) | Чл.-корр. РАН Гальченко В.Ф. | 17 | |
| 4 | Лаборатория реликтовых микробных сообществ | Д.б.н. Пименов Н.В. | 11 | |
| 5 | Лаборатория гипертермофильных микробных сообществ | Д.б.н. Бонч-Осмоловская Е.А. | 13 | |
| 6 | Лаборатория экологии и геохимической деятельности микроорганизмов | Засл. деятель науки РФ, д.б.н., проф. Горленко В.М. | 11 | |
| 7 | Лаборатория микробиологии болотных экосистем | Д.б.н. Дедыш С.Н. | 4 | |
| 8 | Лаборатория хемолитотрофных микроорганизмов | Д.б.н. Кондратьева Т.Ф. | 8 | |
| 9 | Лаборатория микробиологии антропогенных местообитаний | Д.б.н. Ножевникова А.Н. | 5 | |
| 10 | Лаборатория вирусов микроорганизмов | К.б.н. Летаров А.В. | 5 | |
| 11 | Лаборатория экспериментальной микологии | Засл. деятель науки РФ, д.б.н., проф. Феофилова Е.П. | 5 | |
| Итого по научно-исследовательским подразделениям 105 | ||||
Сотрудники Института микробиологии
2012 год
Наиболее важные научные достижения ИНМИ РАН, вошедшие в Отчетные доклады Президиума РАН (2007-2011 гг.):
2007 г.
- Широкомасштабные исследования интенсивности биогеохимических (микробных) процессов циклов углерода и серы в водной толще и донных осадках морей Антарктического бассейна установили, что в Белом и Карском морях наиболее интенсивные процессы деструкции органического вещества, сульфатредукции и образования метана обнаружены в поверхностных осадках зоны смешения морских и пресных вод. В Чукотском море за счет малых глубин и агрегированности бактериопланктона основные исследованные микробные процессы происходят на поверхности донных отложений, где наблюдается аномально высокая плотность бентосных организмов (Экология организмов и сообществ).
- В содовых озерах – аналогах докембрийских континентальных водоемов – впервые обнаружены представители всех основных филогенетических групп аноксигенных фототрофных и сероокисляющих бактерий. Выделены и описаны 8 новых родов и 24 вида фототрофных, хемолитавтрофных, алкалогалофильных бактерий. Общим отличием выявленных экстремофильных видов является их способность с существованию в щелочных условиях. Изучены галопротекторные механизмы алкалогалофильных сероокисляющих бактерий, способных к серному, фумаратному и нитратному дыханию. Эти микроорганизмы были использованы в биотехнологическом процессе очистки отходов от сероводорода (Биологическое разнообразие).
- Определена полная нуклеотидная последовательность генома гипертермофильного микроорганизма Proteinoruptor kemchatskensis, выделенного из гейзера на Камчатке (совместно с ЦБ РАН; Молекулярная генетика. Механизмы реализации генетической информации. Биоинженерия).
- Уточнен состав микробной трофической цепи и определены закономерности функционирования микробного сообщества высокотемпературных нефтяных пластов (Биотехнология).
2008 г.
- В области изучения эволюции живых систем продолжены исследования фактической последовательности появления и развития крупных групп организмов в геологической летописи; они позволяют сделать вывод о существовании на Земле прокариотной жизни, по крайней мере, с начала формирования первых осадочных пород (3,8 млрд. лет назад), появления эукариотных организмов с конца архея (2,9 млрд. лет назад) и о кембрийском времени формирования всех современных типов животных (540 млн. лет назад). Проделанная работа значительно уменьшает неполноту палеонтологической летописи и является основой для разработки современной модели эволюции живых систем организменного и надорганизменного уровней сложности (совместно с ПИН РАН; Биологическое развитие и эволюция живых систем).
- В микроорганизмах обнаружены новые патентно-чистые термостабильные ферменты, перспективные для использования в промышленной биотехнологии и молекулярной диагностике (Биотехнология).
- В целях интенсификации экологически чистых биогидрометаллургических технологий получения благородных и цветных металлов из концентратов сульфидных руд введена стадия химического окисления концентрата ионами трехвалентного железа, получаемыми на стадии биоокисления из концентрата руды Олимпиадинского месторождения. Введение этой стадии позволит снизить общее время биоокисления в 1,5-2 раза, повысить степень окисления сульфидных минералов на 20%, а извлечение золота цианированием – на 25% по сравнению с контрольным одностадийным процессом. Показано, что введение первой химической стадии в технологию бактериально-химического выщелачивания сульфидного пиритного концентрата, содержащего никель, медь, кобальт, золото и платину, снижает время выщелачивания цветных металлов со 120 до 50 ч (Биотехнология).
2009 г.
- Проанализированы геномы двух гипертермофильных архей, представителей новых порядков: Fervidococcus fonti (пор. Fervidococcales) и Acidilobus saccharovorans (пор. Acidilobales). Полученные данные позволили более полно охарактеризовать метаболизм этих микроорганизмов, а также выявить у них возможные новые биохимические механизмы (Структура и функции биомолекул и надмолекулярных комплексов; совместно с ЦБ РАН).
- Разработан флуоресцентный олигонуклеотидный зонд для специфической детекции клеток Methyloferula sphagni, который был использован для определения популяционной численности этого метанотрофа в болотных экосистемах (Биотехнология).
- Проведены эксперименты по определению вклада факультативных метанотрофов с растворимой формой метанмонооксигеназы в общую метанокисляющую активность сфагнового торфа. Показано, что последняя может составлять до 50% общей активности окисления метана (Биотехнология).
2010 г.
- Изучение трофических взаимодействий в железоредуцирующем сообществе низкоминерализованного содового озера Хадын проведено в бинарной культуре двух недавно описанных бактерий – органотрофа Anaerobacillus alkalilacustre и железоредуктора Geoalkalibacter ferrihydriticus. При сбраживании маннита Anaerobacillus alkalilacustre основными метаболитами были формиат, ацетат, лактат, этанол и сукцинат, которые в дальнейшем могли использоваться Geoalkalibacter ferrihydriticus в качестве донора электронов при железоредукции. Установлено, что восстановление железа в бинарной культуре идет интенсивнее, чем в монокультуре Geoalkalibacter ferrihydriticus на ацетате. В бинарной культуре Geoalkalibacter ferrihydriticus использовал в качестве донора электронной не ацетат, а формиат. Эта особенность позволила обнаружить у него ранее не выявленную способность к использованию водорода при восстановлении аморфной гидроокиси железа. Подтверждены установленные ранее закономерности преимущественного образования сидерита как основного продукта при малых исходных количествах аморфной гидроокиси железа и, напротив, магнетита при больших количествах окисного железа. Таким образом, на основании предварительной обработки полученных результатов показано, что использование субстрата в чистой культуре не является доказательством того, что этот субстрат будет использоваться в сообществе при наличии других альтернатив (Экология организмов и сообществ).
- На примере галоалкалофильной натронофильной цианобактерии «Euhalothece natronophila» Z-V001 выявлены отличия процесса карбонатизацции цианобактерий в содовых озерах от морских и пресноводных систем. Показано, что происходит сорбция и кристаллизация аморфного СаСО3 на поверхностном слое клеточной оболочки, предположительно включающий поли(олиго)сахаридные и/или (глико)протеиновые компоненты. При включении в трону происходит присоединение кристалла к внешней мембране и отрыв ее от слоя пептидогликана, приводящее к гибели клетки. Установлено, что в обоих случаях минерализующиеся клетки утрачивают фотосинтетическую активность (Экология организмов и сообществ).
- В результате анализа полученных ДНК- и РНК-клонотек выявлено геномное разнообразие аэробных углеводородокисляющих бактерий из высокотемпературного нефтяного месторождения Даган (КНР): в культурах выявлены метаболически активные микроорганизмы. Выделены растущие на нефти термофильные (Geobacillus stearothermophilus и G. pallidus) и мезофильные бактерии (Shewanella putrefaciens, Pannonibacter phragmitetus и Pseudomonas putida). Их изоляты доминировали, соответственно, в культуре из добывающей скважины и в зоне нагнетательных скважин, где температура пласта снижается с 60 до 40-50°С (Биотехнология).
- Впервые показано, что гуминовые кислоты стимулируют дыхательные процессы, связанные с окислением нефтепродуктов: при их концентрации 0,1-0,2% деструкция углеводородов ускоряется в 5 раз. В присутствии ацетата и минеральных солей азота и фосфора дыхательная активность микрофлоры нефтешлама увеличивается в 4,5 раза; при введении углеводородокисляющей микрофлоры и биогенных элементов скорость дыхания возрастает в 10 раз. Впервые установлен нелинейный характер действия природных мелиорантов (глауконита, древесных опилок и др.) на деструкцию углеводородов в нефтешламе (Биотехнология).
2011 г.
- Разработана методика обнаружения ископаемых бактерий в горных породах и метеоритах. Опубликован атлас «Ископаемые бактерии и другие микроорганизмы в земных породах и астроматериалах», содержащий более 280 иллюстраций. На этой основе создана возможность биологического исследования ранних стадий эволюции Земли, а также показано, что микроорганизмы возникли за пределами Земли и еще до времени ее возникновения (ИНМИ РАН совместно с ПИН РАН и Центром космических полетов НАСА) (Биология развития и эволюция живых систем).
- Установлено, что в современных высокоминерализованных содовых озерах присутствуют хемолитотрофные гомоацетогенные бактериии. Выделен и описан первый гомоацетатный экстремально натронофильный организм Fuchsiella alkaliacetigena gen. nov., sp. nov., осуществляющий синтез ацетата за счет восстановления углекислоты водородом при рН 10. Роль хемолитотрофных водородиспользующих гомоацетогенных бактерий на заключительных этапах деструкции органического вещества в содовых экосистемах могла быть более значительной в докембрии в условиях недостатка сульфата и неразвитого цикла серы (Экология организмов и сообществ).
- Из биообрастаний, обнаруженных на различных материалах (обшивка авиационного кресла, оплетка проводов, смазка и т.п.) в условиях тропического климата Вьетнама, выделены доминирующие бактериальные культуры. Исследованы их основные физиолого-биохимические свойства, такие как температурный диапазон роста, подвижность, спорообразование, используемые органические субстраты (в том числе алифатические и ароматические углеводороды). Показано, что все выделенные микроорганизмы способны развиваться при температуре выше 37°С. Большинство штаммов росло при температуре выше 40°С и некоторые выше 50°С. Проведенные биологические и молекулярно-генетические исследования позволили идентифицировать выделенные микроорганизмы (Биотехнология).
- Изучена деструктивная активность выделенных штаммов по отношению к отдельным материалам, используемым в авиационной промышленности, и сопоставлена с активностью стандартных тест-культур. Выделенные штаммы микроорганизмов оцениваются как обладающие более высокой деструктивной способностью (Биотехнология).
В соответствии с приказом руководителя Федерального агентства научных организаций М.М. Котюкова от 31.12.2014 г. № 1420 проведена реорганизация, и на базе Института биохимии им. А.Н. Баха РАН, Института микробиологии им. С.Н. Виноградского РАН и Центра «Биоинженерия» РАН создано ФГУ «Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» Российской академии наук».
Институт микробиологии им. С.Н. Виноградского продолжил свою научную деятельность в рамках новой организации в виде структурного подразделения с прежним составом лабораторий.