Новые образовательные практики: принципы инженерии в биологии


В рамках реализации новых образовательных практик 12 апреля 2021 г. на базе ФИЦ Биотехнологии РАН состоится открытая лекция к.ф.-м.н. Шайтана Алексея Константиновича «Принципы инженерии в биологии», состоящая из двух частей.

Формат лекции для сотрудников и обучающихся ФИЦ Биотехнологии РАН очный с соблюдением санитарно-профилактических мер, дополнительно предусмотрена видеотрансляция для всех желающих.

Лектор: к.ф.-м.н. Шайтан Алексей Константинович
Дата: 12.04.2021 (понедельник)
Время проведения: 10:00 – 13:15
Адрес: конференц-зал Института биохимии им. А.Н. Баха (Ленинский проспект, д. 33, стр. 2)

 

Аннотация лекции:

Две части лекции «Принципы инженерии в биологии» будут посвящены обсуждению активно развивающегося направления биологической науки и технологии, связанного с внедрением инженерных подходов для решения биологических задач. Такие подходы характерны для новых областей биологии, называемых инженерная биология, или синтетическая биология.

Первая лекция будет носить научно-популярный характер, будут обсуждаться примеры внедрения принципов абстракции, автоматизации, стандартизации, разделения дизайна и производства применительно к биотехнологическим задачам. Будут обсуждаться подходы автоматизации биодизайна (bio-design automation), проектирования генетических схем, создания систем автоматизированного проектирования (САПР) биологических систем, тенденции в области массивно-параллельного синтеза ДНК, создания генетических конструкций, создания логических схем на основе генетических сетей, этические и юридические вопросы инженерной биологии. К обсуждению предлагается опыт подготовки и участия команд студентов и аспирантов в международном конкурсе по инженерной биологии iGEM и критерии успешности проектов.

Во второй лекции в дискуссионной форме будут более глубоко разобраны некоторые темы инженерной биологии для слушателей с базовым биологическим образованием. К ним относятся вопросы хранения, происхождения экспериментальных данных и протоколов (data provenance), обмена лабораторными данными, данными о генетических последовательностях, ведение электронных лабораторных журналов; вопросы автоматизации и программирования протоколов биологических экспериментов (язык Autoprotocol); вопросы моделирования генетических схем и типичные примеры генетических схем.