Группа биохимии адаптации микроорганизмов

Салина Елена Геннадьевна
Руководитель группы
доктор биологических наук
ИНБИ, корп. 2, комн. 207

 

Telefone +7 (495) 954-40-47
E-Mail elenasalina@yandex.ru

Основное

ОПИСАНИЕ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ ГРУППЫ

Ключевые слова
Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium abscessus, микобактерии, латентный туберкулез, антибактериальные соединения, взаимодействие «патоген-хозяин», малые регуляторные РНК бактерий, транскриптомика

Направления исследований

  • Изучение функциональной роли малых регуляторных РНК бактерий
  • Изучение взаимодействия «патоген –хозяин» при инфекции
  • Транскриптомика микобактерий (совместно с ИБХ РАН)
  • Исследование новых антибактериальных соединений и установление механизма их действия
  • Установление механизмов резистентности бактерий к антимикробным агентам

Основные методы исследований

  • Культивирование микобактерий, в том числе  с получением метаболически инертных форм
  • Выделение и очистка РНК
  • Транскриптомный анализ микобактерий методом RNA-seq
  • Определение минимальной ингибирующей концентрации  антибактериальных агентов in vitro (REMA assay) и ex vivo
  • Культивирование и инфекция макрофагов
  • Получение штаммов бактерий с делеций генов методом аллельного обмена
  • Получение  штаммов, гиперэкспрессирующих целевые гены
  • Количественная ПЦР в режиме реального времени

Краткая история группы
Группа образована в июне 2022 года в результате реорганизации лаборатории биохимии стрессов микроорганизмов. Входит в состав отдела медицинской микробиологии ФИЦ Биотехнологии РАН.

 

Сотрудники

СОСТАВ ГРУППЫ

№ ФИО Ученая степень, звание Должность Место работы Городской телефон Внутренний телефон E-mail
1Салина
Елена Геннадьевна		д.б.н.руководитель группы, в.н.с.ИНБИ, корп. 2, комн. 207(495) 954-40-47138elenasalina@yandex.ru
2Артюхина
Мария Викторовна		-м.н.с.ИНБИ, корп. 2, комн. 32(495) 954-40-47138masha.artyuhina@yandex.ru
3Дементьева
Ксения Алексеевна		-ст. лаборантИНБИ, корп. 2, комн. 32(495) 954-40-47138tukzar674@mail.ru
4Мартини
Билли Александровна		-м.н.с.ИНБИ, корп. 2, комн. 207(495) 954-40-47138abillymartiny@gmail.com

Публикации

ЗНАЧИМЫЕ ПУБЛИКАЦИИ
  1. Egorova A, Salina EG, Makarov V. Targeting Non-Replicating Mycobacterium tuberculosis and Latent Infection: Alternatives and Perspectives. Int J Mol Sci. 2021 Dec 10;22(24):13317. doi: 10.3390/ijms222413317.PMID: 34948114.
  2. Grigorov A, Bychenko O, Salina EG, Skvortsova Y, Mazurova A, Skvortsov T, Kaprelyants A, Azhikina T. Small RNA F6 Provides Mycobacterium smegmatis Entry into Dormancy. Int J Mol Sci. 2021 Oct 26;22(21):11536.
  3. Bychenko O., Skvortsova Y., Ziganshin R., Grigorov A., Aseev L., Ostrik A., Kaprelyants A., Salina E.G., Azhikina T. Mycobacterium tuberculosis Small RNA MTS1338 Confers Pathogenic Properties to Non-pathogenic Mycobacterium smegmatis. Microorganisms 2021, 9, 414.
  4. Monakhova N, Korduláková J, Vocat A, Egorova A, Lepioshkin A, Salina EG, Nosek J, Repková E, Zemanová J, Jurdáková H, Górová R, Roh J, Degiacomi G, Sammartino JC, Pasca MR, Cole ST, Mikušová K, Makarov V.Design and Synthesis of Pyrano[3,2-b]indolones Showing Antimycobacterial Activity. ACS Infect Dis. 2021; 7(1):88-100.
  5. А. А. Острик, Т. Л. Ажикина, Е. Г. Салина. Малые некодирующие РНК и их роль в патогенезе Mycobacterium tuberculosis. Успехи биологической химии. 2021, том 61, с. 229-253.
  6. Makarov V, Salina E, Reynolds RC, Kyaw Zin PP, Ekins S. Molecule Property Analyses of Active Compounds for Mycobacterium tuberculosis. J Med Chem. 2020, 63, 17, 8917–8955.
  7. А. А. Острик, Е. Г. Салина, Ю. В. Скворцова, А. С. Григоров, О. С. Быченко, А. С. Капрельянц, Т. Л. Ажикина. Малые РНК Mycobacterium tuberculosis в адаптации к стрессовым условиям, моделирующим инфекцию in vitro. Прикладная биохимия и микробиология. 2020. том 56, № 4, с. 336–341.
  8. Chiarelli LR., Salina EG., Mori G, Azhikina T, Riabova O, Lepioshkin A, Grigorov A, Forbak M, Madacki J, Orena BS, Manfredi M, Gosetti F, Buzzi A, Degiacomi G, Sammartino JC, Marengo E, Korduláková J, Riccardi G, Mikušová K, Makarov V, Pasca MR. New insights into the mechanism of action of the thienopyrimidine antitubercular prodrug TP053. ACS Infect dis 2020; 6(2):313-323.
  9. Skvortsova YV, Salina EG, Burakova EA, Bychenko OS, Stetsenko DA, Azhikina TL. A new Antisense Phosphoryl Guanidine Oligo-2′-O-Methylribonucleotide Penetrates Into Intracellular Mycobacteria and Suppresses Target Gene Expression. Front Pharmacol. 2019, 10:1049.
  10. Salina EG, Grigorov A, Skvortsova Y, Majorov K, Bychenko O, Ostrik A, Logunova N, Ignatov D, Kaprelyants A, Apt A, Azhikina T. MTS1338, A Small Mycobacterium tuberculosis RNA, Regulates Transcriptional Shifts Consistent With Bacterial Adaptation for Entering Into Dormancy and Survival Within Host Macrophages. Front Cell Infect Microbiol. 2019, 9:405.
  11. Salina EG, Grigorov AS, Bychenko OS, Skvortsova YV, Mamedov IZ, Azhikina TL, Kaprelyants AS. Resuscitation of dormant «non-culturable» Mycobacterium tuberculosis is characterized by immediate transcriptional burst. Front Cell Infect Microbiol 2019, 9:272.
  12. Salina EG, Ekins S. Makarov V. A Rapid method for estimation of the efficacy of potential antimicrobials in humans and animals by agar diffusion assay. Chemical Biology & Drug Design 2019, 93(6):1021-1025.
  13. Salina EG, Huszár S, Zemanová J, Keruchenko J, Riabova O, Kazakova E, Grigorov A, Azhikina T, Kaprelyants A, Mikušová K, Makarov V. Copper-related toxicity in replicating and dormant Mycobacterium tuberculosiscaused by 1-hydroxy-5-R-pyridine-2(1H)-thiones. Metallomics 2018, 10(7):992-1002.
  14. Kaprelyants A., Salina EG, Makarov V. How to kill dormant Mycobacterium tuberculosis. Int J Mycobacteriol2018 7:399-400. doi: 10.4103/ijmy.ijmy_106_18.
  15. Salina EG, Ryabova O, Vocat A, Nikonenko B, Cole ST, Makarov V. New 1-hydroxy-2-thiopyridine derivatives active against both replicating and dormant Mycobacterium tuberculosis. J Infect Chemother 2017, 23(11):794-797.

 

Услуги

УСЛУГИ 
  • Определение антибактериальной активности химических соединений  (минимальная ингибирующая концентрация, бактерицидное/бактериостатическое действие) в отношении широкого спектра бактерий in vitro и ex vivo.